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简述信息一览:

CRISPR中sgRNA的设计

sgRNA设计原则: 特异性:确保sgRNA高度特异性,避免非特异性编辑。 GC含量平衡:GC含量应维持在4060%之间,以提高杂交效率。 避免多剪切位点:sgRNA在基因组中不应存在多个剪切位点,减少非预期的多基因编辑。 避免重复或高度相似序列:降低非特异性剪切的可能性。

CRISPR中sgRNA的设计需要遵循以下原则:长度与结构:长度为20nt:sgRNA通常是一个20个碱基大小的合成RNA。PAM序列:需要在基因组中寻找PAM序列,其形式为NGG,“N”可以是A、T、C、G中的任意一个。碱基组成:避免4个以上的T结尾:以减少转录过程中的不稳定性。

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(图片来源网络,侵删)

sgRNA是一个20bp大小的合成RNA,可以与Cas9蛋白结合,因此在设计sgRNA之前,需要在基因组中寻找PAM序列(Protospacer Adjacent Motif),其形式为NGG,“N”可以是A、T、C、G中的任意一个。sgRNA的作用类似于向导,引导Cas 9蛋白在特定序列上进行切割。

基因编辑常用技术

综上所述,每种基因编辑技术都有其独特之处。大范围核酸酶技术、锌指核酸酶技术、转录激活因子样效应物核酸酶技术以及CRISPR/Cas9系统在基因组编辑领域各自扮演着重要角色,它们的发展和应用极大地推动了生物科学的进步。

CRISPR/Cas9技术的广泛应用包括:双链断裂的诱导、单链断裂的诱导、碱基编辑、基因表达的激活或下调等。例如,碱基任意转换与增删等操作已经实现。此外,通过将dCas9与转录激活或抑制肽融合,可以实现基因表达的调控。

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(图片来源网络,侵删)

精准编辑表观遗传修饰:CRISPR/dCas9可以用于靶向DNA甲基化修饰和靶向组蛋白修饰,为表观遗传研究提供了强大的工具。 基因及药物靶标基因的确定:CRISPR全基因组筛选技术可用于必需基因及药物靶标基因鉴定,为药物研发提供了新的思路。

基因编辑-载体构建之CRISPR/CAS9

1、CRISPR-Cas9基因编辑载体构建通常包含以下组件:ori(***起始点)、U6启动子、CAG增强子、FLAG标签、Cas9核酸内切酶、bGH poly(A)终止子、AmpR启动子和AmpR氨苄抗性基因等。这些组件共同作用,实现Cas9蛋白的高效表达和sgRNA(引导RNA)的高效合成,为基因编辑提供有力工具。

2、CRISPR/Cas9技术的成功关键在于sgRNA的设计。通过合理设计sgRNA,可以极大地减少非特异性剪切,提高编辑的准确性。科研人员可以通过基因工程改良Cas9,使其对DNA的切割更具特异性,进一步增强了技术的精确性和可靠性。

3、CRISPR/Cas9系统,一种细菌和古细菌在演化过程中形成的适应性免疫防御机制,用于对抗病毒及外源DNA。在哺乳动物细胞中,常用Cas9酶进行基因编辑,其中II型系统中的crRNA与tracrRNA复合形成向导RNA(gRNA),靶向Cas9蛋白,切割DNA特定位点。

4、了解CRISPR-Cas9基因编辑操作,首先,通过人工设计tracrRNA/crRNA,改造形成具有引导作用的sgRNA。这一sgRNA能精准引导cas9对DNA进行定点切割,产生双链断裂,细胞随后通过非同源末端连接(NHEJ)或同源重组机制实现基因的敲除或精确编辑。在操作步骤中,首先对靶基因进行分析。

TALEN技术简介

TALEN技术是一种基于TAL效应物的基因编辑技术。以下是TALEN技术的简介:来源与结构:TALEN技术源自植物细菌黄单胞菌中的TAL效应物。TAL效应物的核心由33至35个氨基酸重复序列构成,其中RVD的变异决定了其对特定核苷酸的识别能力。识别特性:HD专一识别胞嘧啶。NI识别腺嘌呤。NG识别胸腺嘧啶。

TALEN技术简介 2009年,Jens Boch与Adam Bogdanove研究团队从植物细菌病原体中分离出TAL效应物的核苷酸识别编码,发现TAL靶向结构域由33~35个重复氨基酸组成,其中仅两个氨基酸可变,即RVD。

在基因编辑技术的领域里,曾经的锌指技术(图1A中的ZF核酸酶)因其对特定DNA序列的精准定位而备受瞩目。然而,近年来,一种新型技术——TAL效应物和CRISPR的结合,正在全球科研界引起前所未有的关注和热议。

TALEN技术依赖TALE蛋白与非特异性核酸内切酶Fokl,实现基因组高效编辑。TALEN的DNA结合模块化设计,易于组合和修改,适用于多种生物体,但细胞毒性是其局限。TALEN技术已用于临床前研究,如Cellectis基于TALEN的CAR-T细胞治疗,针对非霍奇金淋巴瘤的临床试验。

TALEN和CRISPR都可以应用于生物体中,包括单细胞和多细胞生物,以进行基因修饰。都可以被用于基因治疗:TALEN和CRISPR都是潜在的基因治疗方法,因为它们可以用于纠正病态基因。需要注意的是,TALEN和CRISPR的具体工作机制、设计原理和应用范围都有所不同,所以在具体应用时需要根据需求进行选择。

TALEN 与 CRISPR 技术有如下异同: 原理不同:TALEN 技术利用转录激活因子类型酶和专一性编码序列,来定位特定DN**段;而 CRISPR 技术利用自修复和大量***能力,来定位特征的DN**段。 操纵精度不同:TALEN 技术可准确操纵多个碱基位点,但 CRISPR 技术只能使用一个碱基位点。

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